饱餐后。因为咖啡中的咖啡因会刺激食道下端原先该紧闭的括约肌，使它比较松弛，让胃、十二指肠内容物返流到食管，从而使胃酸、胃蛋白酶、胆盐和胰酶等易损伤食道粘膜，引起炎症、糜烂、溃疡。所以，常在饱食后饮咖啡，会导致食管反复糜烂、溃疡，形成肉芽、瘢痕，最终收缩引起食管狭窄。
空腹喝咖啡。空腹饮用咖啡，交感神经受到刺激、兴奋，会减低食欲。再则，咖啡因是胃酸分泌的强刺激剂，空腹喝咖啡时，易使强酸刺激胃粘膜，导致不适，有胃溃疡或十二指肠的，会加重病情。
高血压人群压力大时慎喝咖啡。研究发现，即使一杯咖啡中的咖啡因剂量(140 mg)也能影响血压，尤其是在压力状态之下表现更为明显。如果这时再加上情绪紧张，就会产生危险性的相乘效果。咖啡因消费过量的人群，特别是心脏病患者，容易诱发心率不齐及心血管疾病。曾有心理学系研究团队发现：压力重重、又酷爱喝咖啡的人出现幻听、幻觉的比率是其他人的3倍，其效果和吃下过多含咖啡因药物类似。
大量饮用咖啡，会消耗体内维生素B群。待咖啡因的效果过去后，由于大量腺苷酸连续冲击人体，人们会感觉疲劳。因为，大量饮用咖啡会造成代谢速度加快，消耗体内与神经、肌肉协调有关的维生素B群，而维生素B1可保持神经系统的平衡和稳定。所以缺乏B族维生素群的人本就比较容易累，于是就会饮更多的咖啡，而咖啡喝多了又会导致B族维生素的消耗，如此便会形成恶性循环。因此，必须熬夜时，少喝咖啡多补充些维生素B群，反而比较有效。
