全基因组测序,有必要做吗?

如果你跟我妈一样,一点遗传学知识都没有,就想知道全基因组测序对你有什么用,我可以先给你讲讲紫薇的故事。

先说点废话,新闻说全基因组测序非常高大上,检测公司说他们的技术非常先进。但别说你了,你的医生也不知道这玩意儿到底能有啥用。测序技术已经很发达,现在的难题不是技术本身,而是如何将这项技术应用到临床。


美国NIH几年前开展了一项临床试验(ClinSeq),目的就是探讨将全基因组测序应用于临床的模式。我有幸作为遗传咨询师参与其中一段时间。我们招募健康成年人,向他们提供全基因组测序前后的遗传咨询,看他们对测序结果的理解程度如何,以及追踪测序结果对他们心理,生活方式和医疗选择的影响。下面介绍的内容都来自于我跟受试者的遗传咨询,除了紫薇的部分。

全基因组测序测神马?

我现在觉得皇阿玛说紫薇是一本深不可测的书是非常有道理的。紫薇如果是本英文书,里面的一个章节就是一条染色体,每个章节里面的段落就是基因,每个段落里的英文字母就是遗传密码。为了读懂紫薇这个人,皇阿玛其实可以找机器把这些字母都扫描一遍。你就发现紫薇这本书长这样:


如果拿你和紫薇做比较,你会发现你们大部分的段落都是一样的,为什么呢?因为你们都是人。比如,紫薇的第三章第一自然段说她应该有两条腿,你的第三章第一自然段应该和她是一样的,因为你也有两条腿。但你可能发现在有些地方,她是A你是T,这点差别叫做变异(variant)。也许一个自然段只有一两处变异,整本书算下来可能有上百万的变异,这些变异造就了你是你,紫薇是紫薇。

每个人都与众不同。全基因组测序就是拿你的书和正规教材比(就是根据一大堆没啥大毛病的健康人群编写的),看你的变异有哪些。变异有很多种,测序都能测出来。但是,你有能力吃成一个大胖子,不代表你应该吃成一个大胖子;虽然测序技术有能力把你所有的变异都找出来,不代表所有的变异你都应该知道。

哪些变异应该让你知道?什么时候让你知道?谁有做决定的权利?你知道了对你有好处吗?有什么坏处吗?怎样保证你能理解这些变异?做决定的时候必须要考虑哪些因素?一说到这些问题我就激动了。这些问题各种专家和领导应该考虑(好像有人在笑),你也要考虑,因为归根结底是你测序。皇阿玛看不懂紫薇,你也别指望有谁能比你更了解自己。

测序的结果有哪些?对你有什么意义?

请看大屏幕:


1. 注意,大部分的变异是良性的,它们和疾病都没有关系。这些变异只是让我们每个人都与众不同。比如紫薇双眼皮你单眼皮,紫薇高鼻梁你塌鼻梁等等。

2. 只有一小部分的变异跟疾病的发生有关系。

(1) 有些变异会解释你的疾病史。比如,你有高血压,我们可能会找到这些疾病的致病基因。这样的结果对你来说也许在意料之中,也没有什么大用。因为就算你不做测序,你也知道你有高血压,家里其他人也知道他们患高血压的风险会增加。而且你该怎么治病还是怎么治病。

(2) 有些变异会给你提供预警。你患某种病的风险可能比其他人高。比如,你有BRCA1/2基因突变,你患乳腺癌卵巢癌的风险比其他人高很多,你的生活方式需要有所改变,你癌症早期筛查的策略也会跟其他人不一样。但是,如果发现你有老年痴呆症的基因变异,你的发病率会比正常人高,发病时间也会提前,可惜现在没有任何预防或者治疗方式。

(3) 有些变异显示你是某种隐性遗传病基因突变的携带者。也就是说,你自己没有任何症状,但如果你的另一半也是携带者,你们的后代患病的风险就会增加。比如地中海贫血。

3. 还有一些变异目前我们知道的信息有限,不知道它是良性的还是跟某种疾病相关的。也许将来的某一天我们会知道。

以上任何一种情况都有可能。如果你现在要决定做测序,你想知道所有跟疾病相关的变异吗?还是只有其中一种?如果情况是3,你愿意收到更新吗?比如,你已经50岁了,你的孩子都很健康,你也不打算要小孩了,你还愿意收到跟某种异性遗传病相关变异的信息更新吗?

你的遗传咨询师或者医生可以帮助你理解这些信息,但最终得到哪些信息,选择权在你。

(作者:关悦,美国遗传咨询协会认证遗传咨询师,毕业于约翰霍普金斯大学/美国国家人类基因组研究中心。)