据检测发现，黄酒中含有较高的功能性低聚糖，对改善肠道的微生物环境确实有不小的作用。
功能性低聚糖是低聚糖的一种。低聚糖又称寡糖类或少糖类，分功能性低聚糖和非功能性低聚糖。功能性低聚糖已日益受世人瞩目。由于人体不具备分解、消化功能性低聚糖的相关酶系统，在摄入低聚糖后，它很少或根本不产生热量，但能被肠道中的有益微生物双歧杆菌所利用，促进双歧杆菌的增殖，改善肠道菌落结构，另外还有抗龋齿，防治糖尿病等生理作用。
黄酒中含有较高的功能性低聚糖。仅已检测的异麦芽糖、潘糖、异麦芽三糖三种异麦芽低聚糖，每升绍兴加饭酒就高达6克。
异麦芽低聚糖具有显著的双歧杆菌增殖功能，能改善肠道的微生物环境。促进维生素B1.维生素B2、维生素B5(烟酸）、维生素B6、维生素B11(叶酸）、维生素B12等B族维生素的合成和钙、镁，铁等矿物质的吸收，不仅能提高机体新陈代谢水平，提高免疫力和抗病力，还能分解肠内毒素及致癌物质，预防各种慢性病及癌症，降低血清中的胆固醇及血脂水平，因此，黄酒中的异麦芽低聚糖已被称为21世纪的新型生物糖源。
白然界中只有少数食品中含有天然的功能性低聚糖，目前已面市的功能性低聚糖大部分是由淀粉原料经生物技术即微生物酶合成的，黄酒中的功能性低聚糖是在酿造过程中在微生物酶的作用下产生的，是天然的功能性低聚糖，而且是葡萄酒、啤酒无法比拟的。有关研究表明，每天只要摄入几克功能性低聚糖，就能起到显著的双歧杆菌增殖效果。因此。每天喝适量黄酒，有助于改善肠道的微生物环境，能起到很好的保健作用。
