进入封建社会后，一般认为在当时的土地制度之下，土地有三种形式，分别为：土地国有、地主所有和农民所有。
地主阶级利用特权兼并土地，逐渐获得更多土地，从而占据封建土地所有制中最大的部分。
随着地主阶级的盘剥，农民承受的苦难日益严重，到东汉末年，中原又陷入长期战乱，加上疾疫、灾荒。据《三国志》载：当时“大乱之后，民人分散，土业无主，皆为公田”，社会上存在大量可资利用的荒田。
为保证粮食稳定供给，曹操在秦汉屯田的基础上开始大规模屯田。据《三国志》载：建安元年（１９６年），“用枣祗、韩浩等议，始兴屯田”，并取得了很大成效。又“是岁乃募民屯田许下，得谷百万斛。于是州郡例置田官，所在积谷。征伐四方，无运粮之劳，遂兼灭群贼，克平天下”。不仅促进北方的经济恢复和发展，还为后来西晋的统一奠定物质基础。
当时的屯田，采取半强制性手段将土地与劳动力相结合，主要有民屯、军屯。以曹魏集团为例，其民屯主要通过招募流民或者士兵在固定的地方进行垦种，由各州郡设置的典农中郎将、典农校尉、典农中尉等主持屯田。民屯的田租一般很重，据《晋书》载：“持官牛田者官得六分，百姓得四分，私牛而官田者与官中分。”
而军屯，则又可分两种：一是为军事需要而设置临时或长期性屯区，一是领兵将领于军事驻地设置屯田。
此后，蜀汉和东吴政权也先后仿效，在自己控制的区域里屯田。这就使得土地国有制，成为三国时期土地制度的主流。
由于政府剥削加重、土地兼并日益严重等因素，曹魏的屯田制到后期渐遭破坏。
按《三国志》云：咸熙元年（２６４），“罢屯田官以均政役，诸典农皆为太守，都尉皆为令长。”
西晋武帝时期，宣布罢民屯农官为郡县。《晋书》载：泰始二年（２６６）“十二月，罢农官为郡县”。
不过，对于军屯，西晋还是相当重视的。据《晋书》载：咸宁元年（２７５）十二月诏曰：“出战入耕，虽自古之常，然事力未息，未尝不以战士为念也。今以邺奚官奴婢著新城，代田兵种稻，奴婢各五十人为一屯，屯置司马，使皆如屯田法。”
此外，当时还推行占田制。朝廷颁布相关诏令，详细规定农民能合法占有的占田，以及应向国家课税的课田数量，并对世家大族占田做明确规定，推动了当时社会的稳定与发展。
到了东晋，继续推行此政策。据《晋书》载，元帝时，就明文规定：“其非宿卫要任，皆宜赴农，使军各自佃作，即以为廩。”也就是专门打造襄沔地区和淮南地区，让这些地区都成为东晋屯田的重点区域。
西晋短暂统一后，全国又陷人了分裂，长期战乱使中原地区出现了大量的无主荒地。至南北朝，当时各分立政权均采取屯田政策，以军屯为主。
北魏孝文帝时期，政府推行均田制，将国有的土地分配给农民耕种，分为露田和桑田。露田不许买卖，在农民死后回收；桑田可以让子孙继承，也可自由买卖，但不能超过规定份额。此外，奴婢也可授予露田，官吏授予公田，离任时转交下任，促进了当时社会的发展。
不过，与两汉屯田多在边疆地区还是有所区别。
在魏晋南北朝时期，大片的“中间地带”成为南北政权的“边疆”地区，从而成为屯田的重要地区。
