1945年，随着欧洲战事进入最后阶段，以及盟军在太平洋战场上的节节胜利，美国高层也在考虑如何对日本本土的进攻，但日军的负隅顽抗，让他们很悲观的认为，进攻会造成100万美军的伤亡，并需要至少一年半甚至更长的时间结束战争。
为此，雅尔塔会议上，美国不惜出卖中国的利益，换取苏联对日本宣战的承诺。会议结束不久，尼米兹发起了硫磺岛战役，原本计划打5天的战役，结果打了一个多月。而没有战斗任务的麦克阿瑟在干什么呢？他还能获得更大的荣誉吗？
不安分的麦克阿瑟，违命为战友们报仇。
尽管盟军解放了马尼拉，但山下奉文指挥残余的17万日军，退守吕宋岛上3个山区负隅顽抗。按照参谋长联席会议的指示，解放其他岛屿的行动交由菲律宾游击队，西南太平洋战区所属部队进行休整、待命，这让麦克阿瑟不以为然。
特别是在解放马尼拉后，他亲眼看到战友成为战俘后，被日军折磨得骨瘦如柴、衣衫褴褛，甚至有相当一部分没有活到战争结束。如果说麦克阿瑟打回菲律宾，可以说是“一雪前耻”，但战友的仇谁报？他决定消灭残余日军，告慰巴丹亡灵。
于是，他自作主张，命令部队扩大战果，解放每一个岛屿，消灭最后一名日军。麦克阿瑟所属部队开始向棉兰老岛、巴西兰岛等岛屿，先后进行了38次登陆作战。在两个月内，除棉兰老岛若干据点外，菲律宾各岛屿基本被解放。
对于顽固的日军，麦克阿瑟根本不给其投降的机会，直接用猛烈的炮火压制，甚至以推土机和坦克开道，将他们封死在坚固的工事里，一点一点地将日军消灭掉。当然，此时的日本大本营早将注意力放在了本土，这些日军只能自生自灭。
菲律宾战役一直进行了好几个月，尤其是棉兰老岛的守军，盟军伤亡比较大，但日军更是伤亡惨重。在盟军不断地打压下，日军大部分逃进了山区，又在盟军和菲律宾游击队的封锁下，大都死于饥饿和疾病，只有极少的人坚持到战争结束。
整个战役，日军被击毙40余万人，而盟军只有6万人伤亡，其中阵亡1.4万人，阵亡比达到了30:1。麦克阿瑟用近乎“赶尽杀绝”的方式，表达了对日军的痛恨，以及为饱受摧残的战俘们报仇。尽管违命，但参谋长联席会议似乎默认了他的行动。
此时，他们有更重要的事情要考虑。
1945年4月，随着战事的进展，对日作战的目标越来越少，维持现状显然不可取，那么统一指挥成了最大的问题，特别是对日本本土的进攻，在麦克阿瑟和尼米兹之间，必须挑选一人担任战役总指挥，但陆、海两军种的矛盾，让他们头疼。
罗斯福选择一个折中的方法，麦克阿瑟指挥太平洋战场上，所有的地面部队和航空兵部队，尼米兹则指挥所有的海军部队，也就是说，参谋长联席会议接管了战役的指挥权，他们二人谁也没有当上总指挥。当然，介于各自战斗没有结束，移交工作慢慢进行。
但是，在实际操作中，麦克阿瑟和尼米兹很快发现这个模式的弊端。因为在任何一场夺岛战役中，海军离不开陆军，同样陆军也需要海军的支援。双方在交接中，都以容易造成战场混乱为由，拒绝交出该属于自己的部队，双方都无功而返。
最后，不得不由两个“大佬”亲自出面解决。尼米兹前往马尼拉与麦克阿瑟进行了2天的商谈，双方都能通情达理的交流，尤其是麦克阿瑟更是念念不忘，尼米兹曾经给予20艘航母的支援，帮其取得了菲律宾战役的胜利，他做出了很大的让步。
两人一致认为，在以后的战役中，所有陆、海军种在登陆前的战斗，由海军统一指挥；登陆后，改由陆军统一指挥。这么做，不仅很好解决了政令统一的问题，而且充分考虑到双方“感情”的因素。这一模式，在冲绳岛战役中得到了验证。
参战兵力几乎囊括了太平洋战区的全部陆、海军部队，负责提供海空掩护任务的，由海军第58特混编队司令由米切尔中将指挥；负责运送登陆作战部队的，由海军特纳中将指挥；地面作战部队，则全部由陆军第十集团军司令巴克纳中将指挥。
战役发起后，划分的部队各司其职，步骤明确、衔接到位。尽管冲绳岛战役，盟军损失惨重，但不能掩盖这种指挥作战模式的优越性。就在麦克阿瑟准备指挥地面部队登陆日本本土的时候，两颗原子弹在日本爆炸，日本宣布投降。
参考文献：《第二次世界大战》、《老兵不死，麦克阿瑟回忆录》
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