1945年4月，随着战事的进展，对日作战的目标越来越少，维持现状显然不可取，那么统一指挥成了最大的问题，特别是对日本本土的进攻，在麦克阿瑟和尼米兹之间，必须挑选一人担任战役总指挥，但陆、海两军种的矛盾，让他们头疼。
罗斯福选择一个折中的方法，麦克阿瑟指挥太平洋战场上，所有的地面部队和航空兵部队，尼米兹则指挥所有的海军部队，也就是说，参谋长联席会议接管了战役的指挥权，他们二人谁也没有当上总指挥。当然，介于各自战斗没有结束，移交工作慢慢进行。
但是，在实际操作中，麦克阿瑟和尼米兹很快发现这个模式的弊端。因为在任何一场夺岛战役中，海军离不开陆军，同样陆军也需要海军的支援。双方在交接中，都以容易造成战场混乱为由，拒绝交出该属于自己的部队，双方都无功而返。
最后，不得不由两个“大佬”亲自出面解决。尼米兹前往马尼拉与麦克阿瑟进行了2天的商谈，双方都能通情达理的交流，尤其是麦克阿瑟更是念念不忘，尼米兹曾经给予20艘航母的支援，帮其取得了菲律宾战役的胜利，他做出了很大的让步。
两人一致认为，在以后的战役中，所有陆、海军种在登陆前的战斗，由海军统一指挥；登陆后，改由陆军统一指挥。这么做，不仅很好解决了政令统一的问题，而且充分考虑到双方“感情”的因素。这一模式，在冲绳岛战役中得到了验证。
参战兵力几乎囊括了太平洋战区的全部陆、海军部队，负责提供海空掩护任务的，由海军第58特混编队司令由米切尔中将指挥；负责运送登陆作战部队的，由海军特纳中将指挥；地面作战部队，则全部由陆军第十集团军司令巴克纳中将指挥。
战役发起后，划分的部队各司其职，步骤明确、衔接到位。尽管冲绳岛战役，盟军损失惨重，但不能掩盖这种指挥作战模式的优越性。就在麦克阿瑟准备指挥地面部队登陆日本本土的时候，两颗原子弹在日本爆炸，日本宣布投降。
麦克阿瑟与尼米茨的荣誉之争，再次引人注目。
1945年8月15日，日本宣布投降的当天，新任总统杜鲁门任命麦克阿瑟，为同盟国军队最高总司令，代表美国、英国、中国和苏联等国，接受日本的投降事宜。担任盟军最高统帅，是麦克阿瑟军事生涯的最高荣誉，更是他日思夜想的职务。
要知道，麦克阿瑟昔日的部下艾森豪威尔，早与他一年前就荣升欧洲盟军最高总司令，这让一向高高在上的麦克阿瑟很是不习惯。尽管这一职务来得有些晚，并且没有什么军事意义，但毕竟了却了他的心愿。麦克阿瑟自然是欣然接受这个任命。
但尼米兹却愤愤不平，在他看来，海军在太平洋战场上的作用比陆军大得多，并且付出了比陆军更大的牺牲，这个任命无疑是让麦克阿瑟和陆军争得了头功，这是他与海军将士们无论如何也不能接受的。美国陆、海两军种的荣誉之争再次升级。
一是，投降仪式由麦克阿瑟主持，但地点选定在一艘海军军舰上进行，哈尔西的旗舰“密苏里号”战列舰作为受降会场，既是对哈尔西战功的认可，也是对老将军的尊重。这个方案得到了杜鲁门的大力支持，因为他的家乡就是密苏里州。
二是，麦克阿瑟代表同盟国在投降书上签字，尼米兹则代表美国签字。让尼米兹略感安慰的是，“密苏里号”将升起他的将旗。殊不知，麦克阿瑟再次表现出蛮横、跋扈的一面，执意也要升起一面自己的将旗。最终，一红一蓝色旗挂在了桅杆上。
更有意思的是，尼米兹给麦克阿瑟专门准备了一艘登陆艇，载他前往“密苏里号”，但麦克阿瑟却认为“太小了，我不乘这小玩意跑13公里”，并坚持乘驱逐舰。看来，在“斗心眼上”、老奸巨猾方面，十个尼米兹也抵不上一个麦克阿瑟。
双方的“明争暗斗”终告一段落。接下来就是令全世界为之瞩目的受降仪式，麦克阿瑟将曾经在丹巴苦战，成为战俘的温莱特和帕西瓦尔两位美、英将军，也邀请到现场并站立在其身后，这既是对战友莫大的安慰，又对得起自己的良心。
尽管日本投降仪式只进行了十分钟，但对麦克阿瑟来说，已经是满满的自豪和优越感，因为这十分钟将向全世界播放，麦克阿瑟俨然成为战争胜利的象征，更是家喻户晓的英雄。而这，正是他极力争取的荣誉，他喜欢受人拥戴的场面。
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参考文献：《第二次世界大战》、《老兵不死，麦克阿瑟回忆录》
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