研究显示，在美国传播的新冠病毒主要毒株来自于欧洲，在美国开始大检测之前的2月份就已经在纽约存在广泛社区传播。
领导该研究的纽约大学格罗斯曼医学院遗传学家Adriana Heguy说，追溯病毒的传播链有助于防疫策略的制定者在未来做出更明智的社会干预措施。
她说：“非常有趣的是，到目前为止，从纽约患者中鉴定出的大多数病毒毒株似乎来自欧洲，这在一定程度上是因为我们一直专注于阻止来自中国的旅行者，而忽视了背后‘盟友’的危险性。”
同时，她指出，这一发现还与在大规模检测开始之前纽约医生已经开始医治的系列神秘的肺炎病例有关。
就是说，在美国开始大检测之前，新冠病毒已经在纽约社区广泛传播。
Heguy的团队从纽约几家医院2月份“神秘”肺炎患者采集的鼻拭子中检测出75个新冠病毒阳性样本，通过对病毒遗传物质的鉴定进行了病毒溯源。
这是因为，我们知道，所有生物都会随时间发生变异。但是，新冠病毒作为一种RNA病毒，特别容易发生变异，RNA每一次复制都会发生错误，导致一些变异。
这种变异越是频繁，越有助于病毒溯源。
也就是说，每一代病毒都具有不同的遗传特征，就像通过人类DNA鉴定可以追溯至父母和祖父母，以及更久远的祖宗一样的道理。
这也是同属RNA病毒的流感病毒每个流感季节都有不同，需要每年接种疫苗的原因。
尽管新冠病毒的突变速度似乎不如流感快，但科学家足以利用其足够多的变异追溯到其详尽的血统变化和迁移。
为了更广泛的进行病毒溯源，纽约团队还将他们采集的样本病毒遗传数据上传到了全球共享的流感数据倡议（GISAID EpiFlu）运行的服务器上，允许来自世界各地的科学家共享数据。
Heguy的团队研究的最早新冠病毒阳性患者没有相关的新冠病毒旅居史和接触史，这意味着他的感染来自于社区中传播。
Heguy明确表示，“通过这位患者病毒的遗传特征，我们基本上可以非常容易地分辨出它是来自英国。”
除了可以有助于确定传播途径外，继续收集更多数据可能具有临床意义。
例如，科学家可能会通过溯源了解到某些毒株是否导致会导致比其他菌株更轻微或更严重的疾病，这可以为为可能的靶向治疗提供指导信息。
研究人员表示，他们现在的研究尚在早期阶段，希望很快能够从每周的病例中收集到约200个样品来进行测序，可以进行更加详尽的溯源。
这种病毒溯源在像我国、韩国这样防疫初步成功而重新开放的国家也具有重要意义。
因为，如果新冠疫情像科学家们怀疑的那样是季节性的，那么，在包括我国在内的很多国家发生第二波，乃至更多波次的传播难以避免。这时，可以通过对感染病毒的即时测序来确定感染是否来源于社区传播。
社区传播意味着找不到明确的传染源和传播途径，往往是大暴发的前奏。
比如，近来我国报告了一些输入病例“相关联”的本地传播病例。这种病例意味着可以找到传染源和传播途径，不属于社区传播，危险性就小得多。
一个地区，哪怕只要发现1例不明来源的病例，往往就意味着存在社区传播，就可以定义为疫情暴发，该地区就可以宣布进入紧急状态。
当然，说回纽约的研究，纽约作为美国的本轮大暴发大流行的疫情中心，病毒主要来源与欧洲，说明前期美国的防疫策略出现了严重的错误，只顾着防备 可能来自我国的输入，却不想被欧洲盟友从背后捅了刀子。
作者：挣脱枷锁的囚徒
