雍正最大的贡献，是以凌厉的手段廓清了康熙晚年的积弊，整顿吏治，消除冗劣，改土归流；改革财政，整肃贪黩，使国库重新充实起来，为乾隆登基把清朝推向鼎盛创造了条件。但在军事上，雍正并不是一位杰出的统帅。他虽然取得了平定青海的胜利，善后措施也十分得力，较好地解决了青海的问题；对加强全国边防也采取了一系列有效措施。但是，他在同噶尔丹策零较量时，由于决策失误、选将不当，使清军在和通泊(今蒙古国科布多省西部山谷中)遭到了一次惨败。
康熙晚年就称赞年羹尧在平定青藏之乱中“办事明敏”。当时年羹尧是四川巡抚，不管军事，只能管一些后勤保障之类的事。康熙立即把他提升为四川总督兼巡抚，以军事为主，把平定青藏之乱的事都统起来(《清史稿·圣祖本纪三》)。
雍正元年(公元1723年)，青海和硕特部可汗罗卜藏丹津，谋求独领西藏和青海的企图未遂，于是纠集诸台吉起兵反清作乱。雍正“命羹尧进讨”，并“谕抚远大将军延信及边防理饷诸大臣，四川、陕西、云南督、抚、提、镇，军事皆告羹尧”。年羹尧点名要二将，一为前锋统领素丹，一为提督岳钟琪，均授参赞大臣衔。雍正帝均“从之”(《清史稿·年羹尧传》)。
雍正二年(公元1724年)，年羹尧坐镇西宁指挥，四方调度。岳钟琪授予奋威将军，在第一线与罗卜藏丹津叛军较量。当时罗卜藏丹津活动在青海河湟地区(青海境内黄河与湟水交汇地带，靠近甘肃)。那里是甘肃进入青海的一条走廊，两边都是祟山峻岭，关隘重重，易守难攻。走廊地带内，有许多厄鲁特蒙古和硕特部驻牧部落，有众多大小头领，他们互相掩护支持，很难对付。
岳钟琪与诸将分道进入这一地区：(一)岳钟琪与侍卫达鼎为南路；(二)总兵武正安为北路；(三)黄喜林、宋可进为中路；(四)副将王嵩、纪成斌负责搜山。岳钟琪部到达哈喇乌苏(蒙古语“哈喇”为黑，“乌苏”为水，地点失考)，天刚亮，“番众末起，即纵击，斩干余人，番众惊走，逐之，一昼夜至伊克喀尔吉(失考)”，俘获部落大酋阿尔布坦温布。“罗卜藏丹津西窜，钟琪逐之，一昼夜驰三百里”，同时分兵一部前去封堵青海西部通往新疆的噶斯口(《清史稿·岳钟班传》)。
罗卜藏丹津“侵镇海堡，都统武格赴援，敌围堡，战六昼夜，参将宋可进等赴援，敌败走”(《清史稿·年羹尧传》)。
岳钟琪追击途中，罗卜藏丹津属下的部落小酋彭错等向他投降。岳钟班命守备刘廷言监视他们当向导，他殿后继续追击。不久又有一位名叫吹因的小酋前来投降，他交代说罗卜藏丹津的落脚地点距此大概只有一百五六十里。岳钟琪命暂时休息一下，“薄暮复进，黎明至其地。罗卜藏丹津之众方散就水草，即纵击，大破之，擒诸台吉”；罗卜藏丹津的母亲阿尔泰哈屯(哈敦)及妇弟阿宝也被俘。“罗卜藏丹津易妇人服以遁”，其狼狈之状，可想而见。岳钟琪又追击到桑驼海(失考)，“不见虏乃还”，余众皆乞降。岳钟琪这次出击，“出师十五日，斩八万余级”，跟随罗卜藏丹津叛乱的部落大酋都被擒获。为了肃清残敌，年羹尧“遣钟琪等督分十一路进剿，悉讨平之”(《清史稿·岳钟琪传》)。
雍正帝的办事风格是快捷、果决。无论什么事，都希望尽快有个了结，不喜欢拖泥带水；年羹尧有能力、有魄力，正好对上了他的要求。
六月，“以青海平定，勒石太学”(《清史稿．世宗本纪》)。雍正根据年羹尧“条上青海善后诸事，请以青海诸部编置佐领”等建议(《清史稿．年羹尧传》)，对青海采取了如下善后措施：(一)将青海和硕特等蒙古各部，仿照外藩蒙古札萨克制，划分为二十九旗，旗设札萨克(一旗之长)，旗下设佐领。各旗首领每年会盟一次，由朝廷派驻的西宁办事大臣主持。各旗王公台吉分班赴京朝贡(三年一贡，分三班，九年一轮)。
(二)青海境内的藏人，以前“惟知有蒙古而不知有厅卫营伍官员”，从此在其所居之地增设卫所，在藏人中设立土司，分别授予千户、百户等头衔，统归附近原设道、厅及新添卫所长官管辖。
(三)改西宁卫为西宁府，设青海办事大臣。下设西宁县、碾伯县、大通卫。新筑大通、白塔、永安三城，分设总兵、参将、游击，屯兵驻守。(四)规定喇嘛寺院规模，房舍不得超过二百间，喇嘛不得超过三百人，每年稽查两次。通过以上措施，加强了清廷对青海的管辖与控制，为最终解决准噶尔问题创造了条件。
但是，年羹尧的张狂和雍正帝的猜忌恰巧也碰到了一起。年羹尧自恃“才气凌厉，恃上眷遇，师出屡有功，骄纵”，飞扬跋扈到了不知天高地厚的地步。出门，侍卫军“前后引导，执鞭坠镫”；入朝，“总督李维钧、巡抚范时捷跪道送迎”；至京师，“行绝驰道。王大臣郊迎，不为礼”；在边，“蒙古诸王公见必跪”，如此等等(《清史稿·年羹尧传》)。他功也立了，人也得罪完了。
雍正三年(公元1725年)二月庚午(初二)，出现“日月台壁，五星联珠”天象。年羹尧疏贺，用了一句“夕惕朝乾”，引起雍正猜忌，大怒：“年羹尧非粗心者，是直不以朝乾夕惕许肤耳。”诏降年羹尧为杭州将军(《清史稿·世宗本纪》)。三月，夺官。四月，山西、川陕、河南、直隶等各地大员及朝臣纷纷上疏，弹劾年羹尧。雍正帝谕：“羹尧谋逆虽实，而事迹末著，肤念青海之功，不忍加极刑”，派人“诏谕羹尧狱中令自裁”(《清史稿·年羹尧传》)。年羹尧，有本事，太张狂，可惜了。
