首先要说明一下无论是杂交还是回交，这些都是育种的手段，目的也很简单就是为了得到优良的性状，例如提升农作物的产量、提高抗病能力抗虫能力，对于一些动物可以提升它们的产仔率，或者说变的身体强壮可以干更多的农活。
但在这里就出现了一个矛盾点，对于人类来说是禁止近亲结婚的，因为亲缘关系很近的时候，可能身体内都含有致病的隐性基因，当夫妻双方都含有这种致病基因的时候，那么后代变呆傻的可能性就很高。用一个模型来说明：假设基因型为Aa，在这里a代表着的是致病基因，那么如果亲缘关系较近的两个人，基因型就可能都是Aa，在这种情况下后代的基因型可能是AA、Aa、aa三种，而aa型的孩子可能就是呆傻的。
但如果夫妻二人中只有一个是Aa型的，另外一个是AA的，那么后代就百分之百的不会出现问题。
但是育种专家却喜欢用回交的方式进行育种，这应该是矛盾所在！因为回交从本质上来说就是近亲繁殖，为了避免引起大家的歧义，在这里用植物来举例说明。例如有两种棉花，其中A棉花有着很好的性状，深受大家喜欢，这种棉花耐寒、耐旱、颗粒饱满并且非常的柔软，但是却有一个缺点那就是不抗虫，经常因为虫灾损失惨重。
而B棉花没有什么特别好的性状，但是有一点比较好，那就是它抗虫灾。因此育种专家为了得到更完美的个体，它就需要应用回交育种的方式。A棉花作为轮回亲本，B棉花作为非轮回亲本，A和B棉花杂交产生子一代F1。在F1中找到具有抗虫病能力的个体，之后与亲本A进行杂交得到F2。按照这个筛选条件不断的让子代个体和轮回亲本进行杂交，回交的次数越多，最后得到的个体就越接近于轮回亲本A同时兼具了亲本B的优良性状。
回交的方式如果放在动物中进行的话，那就存在着很严重的伦理道德问题。并且对于动物来说繁殖周期很长不也支持反复多次的回交工作。但这并不意味着动物不能回交，例如一些实验室的小白鼠，有的时候就需要让它们进行回交。除此之外还有一些纯种的宠物狗也存在这个问题，例如某种非常纯的狗子，在业界可能就有那么几只种狗，因此主要是这种狗都去找那几只进行配种，最后就出现了回交的问题。
因为狗这个物种比较特殊，从生物学分类上来说，我们所能看见的所有类型的狗，它们都属于同一个物种，实际上都是灰狼的亚种，原则上它们之间是可以交配产生后代的。因此也就出现了各种“串”，但是种狗很多人不喜欢，都喜欢纯种的狗。因此一些纯种的狗也是存在一些遗传上的问题的，并且都是先天上的缺陷。BBC就曾拍摄过一个纪录片，有一项研究发现，研究发现，英国的不同家庭里有10000只哈巴狗，神奇的是它们都是50只狗的后代，可想而知遗传病有多严重，其实这些都是人类造成的。
在自然界中大多数动物都会通过一些方式避免发生近亲繁殖或者说回交。例如非洲狮群，一般一个狮群中有1-2只雄狮，6-7只雌狮，还有一些小狮子。当小雄狮长到2岁左右，就会被“狮王爸爸”逐出狮群。我们在《狮子王》中看到的那种情况是不可能发生的，倒是刀疤成为狮王还是比较符合正常情况的。就是为了避免回交的发生，因此小雄狮才会被赶出去另起炉灶。
而小的雌狮会一直留在狮群中长大到成熟，之所以会这样，是因为狮王每两三年可能就会更替一次，重新有年轻力壮的新雄狮上位，因此也不会出现回交的问题。
回交是会出现劣质的后代，当然也可能出现优质的后代，但是对于育种工作就是为了筛选出优质的后代，因此舍弃一些劣质后代也是值得的。但是对于人类来说任何个体都是重于泰山，不可抛弃的，因此禁止近亲结婚是必需的手段，而回交育种确实一种很好的育种方式。
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