如果不理解“基因相似度”的概念，就很容易造成误解，生物之间哪怕是基因相似度1%的差别，也会造成两者的巨大差异，比如人和斑马鱼的基因相似度为87%，与老鼠的基因相似度为90%，与黑猩猩的基因相似度为99%，人与人之间的基因相似度高达99.99%以上。
人类拥有23对染色体，包含2万多个基因，总共30多亿个碱基对；我们经常听说的基因相似度，指的是对应基因中碱基对的一致性，比如某两个基因包含2万个碱基对，如果其中有100个碱基对不同，那么这两个基因的相似度就为：
（20000-100）/20000=99.5%；
对于地球上的动物来说，对应基因相差几个碱基对，其表达形式都有可能千差万别，比如人类当中有一种叫做镰刀型贫血病的隐性遗传病，因为红细胞呈镰刀状（正常为圆饼状）而得名。
然而科学家发现，血红蛋白由500多个氨基酸组成，正常人的血红蛋白和患病者的血红蛋白只区别于一个氨基酸，在β链N末端的第6个氨基酸处，正常人为谷氨酸，患者为缬氨酸，原因是患者DNA中负责血红蛋白的一个碱基对发生了突变，也就是DNA中一个碱基对的变化，就造成了一种遗传病的产生。
类似的例子在生物中很常见，比如人类和家猪的胰岛素只有一个氨基酸不同，人类与牛的胰岛素只有三个氨基酸不同，所以早期治疗糖尿病时，使用猪的胰岛素要比使用牛的胰岛素效果好。
人类拥有2万多个基因，每个基因都有各自的功能，比如负责肤色、身高、单双眼皮等等，也许负责肤色的基因中，也就是几个碱基对的差别，才有了全世界各种肤色的人类，对于不同的物种，基因差别会更大些。
人类和其他动物在形态上千差万别，但是与人类一样，很多动物也只有两只眼睛，一个鼻子，然后五脏俱全，所以这些动物和人类的基因会有很大的相似度，即便如此，剩下百分之几的基因差别，也会导致不同物种间的形态千差万别。
即便是人类当中的同卵双胞胎，两者基因完全相同，长大后双胞胎在性格、长相上也会有一定差异，而两个家族上没联系的人，其基因的相似度也高达99.99%以上。
所以说，人与黑猩猩的基因相似度为99%，与老鼠的基因相似度为90%，与斑马鱼的基因相似度为87%，这样的数据是可以理解的。
这也间接说明了，地球上的生物很可能是同源的，至少很大一部分物种是同源的，也就是由一个最初的物种演化而来；比如地球上最原始的灵长类，可以追溯到7000万年前的普尔加托里猴，该物种的外观就形似松鼠。
在2019年2月，美国科学家有一个发现，他们创造出四种全新的碱基对，并且可以形成稳定的DNA双螺旋结构，这一发现暗示着外星生物体有可能与地球生物有着不同的DNA编码方式，也间接给地球生物同源的说法提供了证据，因为在地球上，使用DNA遗传的生物都是同一套编码方式。
