鲸鲨体型庞大，性成熟时体长至少8-9米，特别大的个体能超过12米，最大达到18米，是现存最大的鲨鱼同时也是最大的鱼类。这个庞然大物虽面目可怖，却性情温顺，属于滤食性鲨鱼，以浮游生物为食。因此，它们不但不会伤害其他种类的鲨鱼和各种海洋哺乳动物，反而经常受到天敌的伤害。
这样的庞然大物，出生时也就40-60厘米，在这个阶段，它们还不具备体型优势，理论上能吃它的掠食者就比较多了，这里就不一一赘述了。我们主要谈谈鲸鲨长到亚成年和成年时，海洋里有哪些掠食者能威胁到它？基本上就是虎鲸和大型掠食性鲨鱼。
首先是虎鲸，凭着体型和群居，虎鲸对鲸鲨的威胁是最大的，下面是几个虎鲸进食/捕杀鲸鲨的例子：
Fertl在1996年的文章里，记录了虎鲸在加利福利亚湾吃鲸鲨的2个例子，不过鲸鲨的体型不详，专家认为是捕食。
同样是在加利福利亚湾，Sullivan观察到虎鲸攻击并杀死了8米的鲸鲨。
为什么攻击总是发生在加利福利亚湾呢？因为每年鲸鲨会到加利福利亚湾繁殖后代，这片海域里有不少未成年的小鲸鲨，还有前来生产的怀孕母鲨，所以该地是作为鲸鲨的产房和苗圃来使用的，虎鲸盯上这些易受捕食的个体就很容易理解了。
接着说掠食性鲨鱼，主要是大白鲨、虎鲨和其他大型真鲨，下面是例子：
西澳宁格罗礁，一只5.5米的鲸鲨被咬掉部分背鳍和左侧的一些组织，推测为虎鲨或大白鲨所为。
对宁格罗礁、塞舌尔和莫桑比克这三地鲸鲨的伤痕研究表明，有不少个体被鲨鱼攻击过，鲨鱼咬伤分别占所有带伤个体的44%，21.4%和14.9%，这样的比例表明鲨鱼对鲸鲨的袭击不容忽视，尤其是宁格罗礁，比例接近一半了。而宁格罗礁的鲸鲨之所以更频繁地受袭，和当地大型真鲨的数量分不开，在该地，鲸鲨季节性聚集的时候，虎鲨和其它大型真鲨也常常被目击到，而塞舌尔和莫桑比克的大型掠食性鲨鱼较少和鲸鲨在同一个季节出没，最终形成了受攻击频率上的差异。
20世纪60年代，在澳大利亚西南部的奥尔巴尼附近海域，一只4.5米的雄性大白鲨被捕鲸站捕到，从它肚子里发现了两枚鲨鱼椎骨，经鉴定，属于一只至少8.5米的鲸鲨，这个报告的结论是无法确定是捕食还是食腐，我们认为，考虑到体型差距，食腐的可能性更大。
所以，目前的证据显示，虎鲸和大白鲨虎鲨等大型掠食性鲨鱼会攻击鲸鲨，而确定能够杀死成年鲸鲨的是虎鲸。那么鲸鲨有什么手段来防御掠食者呢？
第一是体型和防御，鲸鲨体型巨大自不必多说，同时它的防御也是较为出众的，成年个体的皮肤厚度超过10厘米，不是那么容易能够穿透和撕裂的。
第二是深潜，遇到像虎鲸这样的掠食者，它们可以通过下潜来避开对方，资料显示它们可以下潜到水下2000米的位置，更重要的是它们不像鲸鱼那样受到时间限制，可以停留在深水很长时间。
被虎鲨或大白鲨咬伤的5.5米鲸鲨
综合这两点，鲸鲨就具备了足够的空间和时间去避开一些掠食者的追逐。
