关于生命的起源，不管是在多年以前，还是大家生活的当下，都存在着诸多争议的焦点。而在众多解释生命来源的理论中，由达尔文提出的进化论便首当其冲。人类是怎么来到地球上的，人类以后又会去到哪里生活？这些似乎是很多人都会去思考的问题。从《物种起源》首次发表，距今已有一百多年的时间，进化论的缺陷在哪里，为什么现在还有人质疑它的真假、甚至反对进化论？
首先，我们可以从进化论的提出背景来了解，其实不只是我们这个国家有很多人对此存有疑问，即便是国外的很多人也同样不认可这样的理论。放眼整个社会，进化论的存在本身就颠覆了很多人的认知，尤其对于人文领域而言，更是一次巨大的冲击。很大一部分人认为人类就是万物之灵，并不能将自然界中的其他生物与人类放在同一个层面。
更有甚者，他们觉得时间万物只有人才具有灵魂，而其他生物的存在不过是为了更好地为人类服务，不管是什么动物都不可与人类相提并论。而达尔文理念中的人类不过是进化的偶然产物、类人猿这样的动物在本质上和人类一样，就连人类的智慧、乃至道德感都能在其他动物身上映射出来，这一系列理论都让很多人无法接受。
很多“神创论”的人都喜欢用寒武纪大爆发来反驳进化论的真实性，但这短短数百万年的时间，在地球生物的进化历程中其实只是很短的一段时间。并且，从“地球膨裂说”这个角度来看，正是因为当时地球温度的迅速升高，导致了生物的繁衍速度过快，才最终演变成了寒武纪生命大爆发。简而言之，寒武纪生命大爆发其实是进化论的有力证据之一，而并不是为了反对进化论本身而存在。
事实上，科学本身也并不会否定自己的错误和不足，关于传统进化论本身的缺陷，主要存在以下几点：首先，该理论中缺少了过渡型化石，这与其提出的“自然界无跳跃”的说法相矛盾，既然生物的进化过程是缓慢发生的，那么在该物种的过去和现在之间应该存在过渡性的阶段。但是，现在的确有随着越来越多的化石被发现，一些过渡型化石逐渐被找到，尤其是猿到人的人猿化石被发现。
当然，比起原本应该存在上千种的过渡型化石数量而言，人类找到的已知化石看上去就比较少了。而且，客观而言，人类也不太可能收集到所有化石证据。因为，生物化石的形成本身就具有很大的偶然性，这会使得自然界中的化石记录并不会特别完整。而且，从间断平衡理论来看，那些在短时间内就完成物种进化的物种，是很难在这个过程中形成化石的。
而理论中存在的第二个问题，便与我们所生活的地球的年龄有关。在达尔文提出生物进化需要十多亿年时间的时候，当时的物理学家认为地球的历史都只有一亿年左右，而地球上有生命存在的时间更只有两千万年左右。当时的达尔文无法反击物理学家对其理论的质疑，只能将希望寄托于在以后的时间里，会有人计算出更大的地球年龄。
而事实也的确说明了，我们的地球其实已有数十亿年的年龄，而这个结果是由更专业的现代物理学家们测算出来的统一结果。的确，达尔文的进化理论在生物进化的渐变性上有些过度强调，这也是一开始的进化论观点，为什么会受到新灾变论者和间断平衡论者们的反驳。
就本质而言，达尔文的进化理论其实就是基于环境和生物的相互作用，阐述了生物的适应性改变是因为其本身的变异、遗传以及自然选择的结果。客观而言，也正因为该理论具有很多科学事实作为依据，才能经受如此长的时间考验。很多人都将达尔文的进化论观点等同于进化论全部，但该理论也是也在不断的完善和修正之中。
在现代进化论的理论中，已将生物进化的发生条件定义为生物种群之中，更将生物进化和形成过程的三个基本环节称为突变、选择和隔离。理论中不仅确定了自然选择的重要性、进化本身具有渐进性，更强调了进化是群体性特征，并否定了获得性状的遗传说法。而之所以会做出这样的调整，也是因为传统进化论本身的局限性，然后形成了所谓的现代进化论体系。
