2019 年 6 月 19 日，Nature Index 发布 2019 自然指数年度榜单（Nature Index 2019 Annual tables）。该年度榜单按国家和机构追踪 2018 年 1 月-12 月发表在 82 种高水准期刊上的科研成果，计算论文发表总量及每篇论文的作者贡献份额，公布了 2018 年主导自然科学研究的机构和国家排名。
其中全球综合排名前十的科研机构分别为：中国科学院、美国哈佛大学、德国马克思普朗克学会、法国国家科研中心、美国斯坦福大学、美国麻省理工学院、德国亥姆霍兹国家研究中心联合会、英国剑桥大学、日本东京大学和北京大学。
全球高质量科研产出排名前十的国家分别为：美国、中国、德国、英国、日本、法国、加拿大、瑞士、韩国和澳大利亚。
（来源：Nature Index）
此外，“自然指数”还发布了全球学术机构排名，以及在生命科学、化学、物理学、地球和环境科学等领域，按学科分类的高质量科研成果机构排名，还包括一份根据大学最高质量科研在其自然科学总产出中所占比例得出的标准排名。
自然指数采用两种计算论文产出的方法：
? 论文计数 （article count/AC）- 不论一篇文章有一个还是多个作者，每位作者所在的国家或机构都获得 1 个 AC 分值。
? 分数式计量（fractional count/FC）- FC 考虑了每位论文作者的相对贡献。一篇文章的 FC 总分值最多为 1，在认为每位作者都有相同贡献的情况下，所有作者共享分值。例如，一篇论文有十个作者，则每位作者的 FC 得分为 0.1。
中国科研实力继续大幅上升
在全球科研机构综合排名中，除中国科学院位居榜首、北京大学进入前十之外，另外还有 15 家国内大学挺进全球前 100 名，分别是清华大学（13）、南京大学（15）、中国科学技术大学（17）、中国科学院大学（24）、浙江大学（27）、复旦大学（34）、上海交通大学（41）、南开大学（51）、苏州大学（55）、中山大学（56）、武汉大学（59）、四川大学（62）、厦门大学（75）、华中科技大学（78）、湖南大学（99）。
图 | 全球科研机构综合排名前 100 名中，中国大学/机构共有 17 位（来源：Nature）
而从国家层面来看，在主导自然科学研究的前 10 个国家中，美国仍然是遥遥领先的霸主，但中国正在占据越来越大的空间，并不断排挤欧洲的中坚力量。
图 | 全球主导自然科学研究的前 10 个国家，中国排名第 2（来源：Nature）
按 FC 计算，中国科研机构增长最快。在过去 3 年 FC 增幅最大的全球前 50 家机构中，有 43 家在中国，包括前 10 名的所有机构。其中增幅最大的前 5 名机构分别为：中国科学院大学、上海交通大学、清华大学、南京大学、四川大学。
图 | 全球科研贡献增幅最大的 5 名中国机构（来源：Nature）
此外，中国科研实力在世界范围内的迅速崛起并不仅限于数量。去年，Elsevier为《泰晤士高等教育》（THE）做的数据分析表明，中国总体的研究质量可能会在本世纪 20 年代中期超过美国。
这样的崛起当然离不开中国新生代科学家的优异表现，他们卓越的工作成绩正一步步促使中国逐渐站在世界科技之巅。
生命科学领域十大机构
通过追踪的 82 种主要期刊上发表的生命科学论文的最大贡献者，“自然指数”评选出 2018 年生命科学领域机构排名，其中前十大机构分别为：哈佛大学、美国国立卫生研究院、德国马克思普朗克学会、斯坦福大学、中国科学院、麻省理工学院、加州大学旧金山分校、耶鲁大学、剑桥大学和宾尼法尼亚大学。
图 | 生命科学领域十大机构（来源：Nature）
生命科学领域的排名非常稳定，2018 年的前六名与 2017年 的排名保持不变。变化主要发生在前十名的后半部分，剑桥大学较去年的第 16 名上升了 7 位，今年进入了前 10 名榜单。
宾夕法尼亚大学保持着 2017 年以来的第 10 位，巧的是这所大学在过去一年里没有发现分数统计方面的变化。
作为生命科学领域的榜首，哈佛大学每年研究成果的三分之二来自于生命科学领域，这在很大程度上归功于哈佛医学院。哈佛医学院拥有近 10,000 名全职教师，其员工和校友中有 15 名诺贝尔奖获得者。
美国国立卫生研究院由 27 个独立的研究所和各种生物医学学科的中心组成，由人类基因组计划（HGP）的前负责人、遗传学家 Francis Collins 领导。NIH 也是世界上最大的生物医学研究单一公共资助者，2018 年的预算为 370 亿美元。
化学领域十大机构
2018 年化学领域排名前十的机构分别为：中国科学院、法国国家科学研究中心、德国马克思普朗克学会、南京大学、北京大学、清华大学、中国科学技术大学、麻省理工学院、美国西北大学和斯坦福大学。
这是中国、法国和德国连续第四年在高质量化学研究产出方面领先世界。
最大的变化是美国西北大学，从 2017 年的第 17 位跃升至第 9 位，南京大学从去年的 5 位攀升至第 4 位。而日本京都大学去年排名第四，今年却跌出前十。
中国科学院在过去四年的“自然指数”中一直保持着全球化学学科的榜首位置。在 2018 年，中国科学院拥有的化学论文数量几乎是排名第二的法国国家科学研究中心的四倍。
物理学领域十大机构
2018 年物理学领域排名前十的机构分别为：中国科学院、德国马克思普朗克学会、法国国家科学研究中心、麻省理工学院、斯坦福大学、东京大学、哈佛大学、德国亥姆霍兹国家研究中心联合会、瑞士苏黎世联邦理工学院、清华大学。
与化学领域十强一样，中国、法国和德国连续四年在物理学领域名列前茅。
不过，2018 年北京大学和剑桥大学双双跌出物理学前十名，瑞士苏黎世联邦理工学院从 2017 年的第 14 名跃升至 2018 年的第 9 名。清华大学排名上升一位，稳居前十。
图 | 物理领域十大机构（北京大学排名第 11 位）（来源：Nature）
作为世界上最大的研究机构，中国科学院连续四年蝉联物理学领域的第一名，成为“自然指数”追踪的高质量物理研究的头号生产者。
“我们研究机构的规模决定了中科院的最高地位，”中科院物理研究所的著名物理学家刘伍明说。中科院物理研究所拥有一个由 2000 多名研究人员组成的团队，是加州大学伯克利分校等物理研究领先大学的 10 倍。
刘伍明还向Nature表示，“更重要的是，我们有稳定的资金支持长期研究，比如超导。在西方的大学里，教授们通常不得不申请当时‘热门’领域的资金。”
地球和环境科学领域十大机构
2018 年地球和环境科学等领域排名前十的机构分别为：中国科学院、德国亥姆霍兹国家研究中心联合会、法国国家科学研究中心、瑞士苏黎世联邦理工学院、美国国家航空航天局、南京大学、加州理工学院、加州大学伯克利分校、科罗拉多大学博尔德分校和美国地质调查局。
虽然今年许多表现最好的机构都进入了该领域排名的前10名，但地球和环境科学领域仍突出了一些高度专业化的机构，包括加州理工学院、科罗拉多大学博尔德分校和美国地质调查局。
华盛顿大学、美国国家海洋和大气管理局今年双双跌出前 10 名，而中国的南京大学和加州大学伯克利分校则排名上升，分别排在第 6 和第 8 位。
与化学和物理一样，中国科学院连续四年在地球和环境科学领域保持第一名。在中国科学院的 105 个研究机构中，至少有 28 个主要研究地球和环境科学，他们的专业包括生态学、采矿学、海洋学和古生物学。
首次纳入的标准排名
在历史悠久、声誉良好、资金充裕和规模庞大等因素的支撑下，一些知名机构主导了 2019 年自然指数年度排行榜。但在标准排名的前 10 名中，排名发生了变化，常规的排名方法看到一些著名研究机构与其在标准排名表中的位置相比略微下滑。
标准排名（standard Nature Index）是通过计算自然科学中 FC 与该机构的总文章输出的比率得出的。标准化排名的学术机构前三位分别是：美国冷泉港实验室、奥地利科学技术研究所和以色列魏茨曼科学研究所。
与哈佛大学等大学相比，标准化排名前十的一些大学论文数量很少，比如排名第一的冷泉港实验室，在年度排行榜上却排在 345 位；仅拥有 30 年历史的印度贾瓦哈拉尔·尼赫鲁高级科学研究中心(Jawaharlal Nehru Centre for Advanced Scientific Research)在标准排名中排名第七，在常规排名中则是第 413 位。
一些学术机构的情况比它们的声誉可能预测的要糟糕得多，而另一些则要好得多。正如标准分析所表明的，机构规模大小并不是一切，等级也不是一切。
自然指数创始人 David Swinbanks 说：今年自然指数年度排行榜中加入了一项标准化的排名，这一点尤其有趣，因为该排名吸引人们关注的是一些规模较小的机构，否则排名中仍将处于较低的位置。前十名中最小的机构都有一些共同的特点：野心，如努力成为世界上最好的机构；跨学科性，具有跨领域合作的强烈意愿；或者诺贝尔奖得主的支持。”
此外，“自然指数”榜单还发布了顶级企业科研机构、顶级医疗机构、顶级政府机构和非营利组织/非政府组织机构榜单。
排名前十的企业科研机构分别为：罗氏、IBM、诺华、默克、阿斯利康、辉瑞公司、谷歌母公司 Alphabet、日本电报电话公司、葛兰素史克、安进公司（七家为跨国制药巨头）。
图 | 排名前十的企业科研机构
排名前十的顶级医疗机构分别为：哥伦比亚大学欧文医学中心、德克萨斯大学西南医学中心、加州大学圣地亚哥分校健康科学中心、华盛顿大学医中心、杜克大学医学中心、密歇根大学医学中心、德克萨斯大学安德森癌症中心、纪念斯隆·凯特琳癌症中心、马萨诸塞州总医院和加州大学洛杉矶分校健康中心。
图 | 排名前十的顶级医疗机构
排名前十的政府科研机构分别为：中国科学院、法国国家科学研究中心、美国国立卫生研究院、西班牙国家研究理事会、美国劳伦斯伯克利国家实验室、日本理化学研究所、美国阿贡国家实验室、意大利国家国家核物理研究所、美国国家航空航天局和意大利国家研究理事会。
图 | 排名前十的政府科研机构
排名前十的非营利组织/非政府组织机构分别为：德国马克斯普朗克学会、德国亥姆霍兹国家研究中心联合会、德国莱布尼茨学会、俄罗斯科学院、美国斯克里普斯研究、巴塞罗那科学技术学院、卡内基科学研究所、索尔克生物研究所、普里美特理论物理研究所和美国国家大气研究中心。
图 | 排名前十的非营利组织/非政府组织机构
关于自然指数
自然指数于 2014 年 11 月首次发布，追踪高质量自然科学期刊所发表的科研论文的作者信息。自 2018 年 6 月起，纳入指数的期刊数量已由 68 本增至 82 本。
期刊选拔流程由生命科学和自然科学领域在职科学家组成的两个独立小组负责领导，最终结果通过参考 6600 多位科研人员对一项电邮调查的回复而确定下来。该调查的主题是：“您会把自己最好的研究成果发表到哪里？”
根据知识共享协议，自然指数最近十二个月的滚动数据窗在指数网站 natureindex.com 上公开发布，以方便使用者分析超过 9000 家机构和 150 个国家的科研产出及相互间合作情况。该网站还按照大的学科领域列出各科研机构最近 12 个月的论文产出，其国际和国内的科研合作情况也有显示。
网站还提供回溯到 2015 年的机构和国家年度排名。使用者在免费注册后，即可绘制机构和国家科研产出的纵向发展趋势，并导出原始数据做进一步分析。
