用CRISPR-Cas9改造的抗病毒木薯,促进病毒更快进化?

根据Genome Biology近日发表的一项最新研究,加拿大阿尔伯塔大学、比利时列日大学和瑞士联邦理工学院的植物生物学家发现,使用 CRISPR-Cas9 基因编辑系统制造抗病毒的木薯植物,可能会产生严重的负面影响。研究结果表明,尝试对植物进行基因工程改造以使其具备抗病毒能力,实际上却会导致突变病毒在受控实验室条件下的传播。

这个由生物学家组成的国际小组,敦促在研究中谨慎使用 CRISPR-Cas9 基因编辑技术,并指出潜在的生物安全风险。

“我们得出这样的结论,是因为 CRISPR 基因编辑技术对病毒产生了选择压力,迫使它们更快地进化,同时也为病毒提供了一种进化的手段,导致出现对我们的干预措施具有抗性的病毒突变体。”研究论文通讯作者、瑞士联邦理工学院生物科学系博士后 Devang Mehta 解释道。

(来源:麻省理工科技评论)

CRISPR 是细菌的一种免疫系统——这种系统可以使细菌抵御病毒感染或者其他细菌的基因转入。在过去几十年里,全球科学家就 CRISPR 的工作原理以及如何改造 CRISPR 做了大量工作,以使其成为基因工程领域的有效工具。

然而,这项最新研究发现,该技术在植物中产生了截然不同的结果,研究人员同时强调了在未来筛查这些非预期结果的重要性。

作为研究对象的木薯,是一种在热带地区被广泛食用的含淀粉根茎类植物。木薯在南美洲、非洲和亚洲也是主要的粮食作物,有超过 10 亿人在食用。但是,每年木薯都受到木薯花叶病的困扰,造成 20% 的作物损失。

图 | 患病(左)和健康(右)的木薯植物(来源:HervéVanderschuren)

在这项最新研究中,研究人员使用 CRISPR-Cas9 基因编辑技术试图改造木薯,目的是使木薯可以切割花叶病毒的 DNA 并对非洲木薯花叶病毒产生抗性。但不幸的是,结果并不成功。在温室接种过程中,CRISPR-Cas9 系统无法赋予木薯对病毒的有效抗性。

此外,研究人员还发现 33% 至 48% 的编辑病毒基因组进化出一个保守的单核苷酸突变,赋予对 CRISPR-Cas9 切割的抗性。

为了解原因,该团队对每株植物中的数百种病毒基因组进行了测序。”我们发现,CRISPR-Cas9 对病毒施加的压力,可能会促使它以一种增加干预抵抗力的方式进化。”Mehta 也特别补充说,”CRISPR-Cas9 在食品和农业中有许多其他应用,不会产生同样的风险。”

研究小组希望与使用 CRISPR-Cas9 技术设计抗病毒植物的其他科学家分享他们的研究结果,并希望这些研究团队在他们的研究中检测类似的病毒突变。

“在进行田间实地试验之前,我们需要对 CRISPR-Cas9 技术这些类型的应用进行更多的研究。”Mehta 表示。